Jeg har en ny sekvens, og jeg vil legge den til i en forhåndskonstruert BLAST-database som inneholder andre sekvenser. Makeblastdb-hjelpen gir ikke noe hint om denne forholdet.
Du kan bruke blastdbcmd til å trekke ut FASTA-sekvenser fra BLAST-databasen. Deretter kan du legge til den ekstra sekvensen til den nylig opprettede FASTA-filen, og lage BLAST DB på nytt med makeblastdb . Forutsatt at du har en protein BLAST-database i gjeldende arbeidskatalog, og en sekvens du vil legge til i ny.fa:
$ blastdbcmd -db proteindb - dbtype prot -out db.fa -entry all $ cat new.fa >> db.fa $ makeblastdb -in db.fa -out newproteindb -dbtype prot (Erstatt prot med nucl hvis du har en nukleotiddatabase)
Du kan opprette en ny database med de nye sekvensene og opprette et alias som knytter gamle og nye databaser til blastdb_aliastool