Spørsmål:
Er det meste av det menneskelige genomet funksjonsløst “søppel-DNA”?
Charlie
2017-08-27 18:20:29 UTC
view on stackexchange narkive permalink

I januar 2012 ga David Icke ut en bok (ISBN: 9780955997334) med tittelen "Husk hvor du er og hvor du kommer fra" der han utfordret det han hevdet å være synet fra vanlig vitenskap om at 90–97% av menneskelig genom var “søppel-DNA” og hadde ingen funksjoner. Han antydet i stedet at det måtte ha en funksjon, men at dette var ukjent.

Er det fortsatt sant at vi ikke vet hva alt dette DNAet gjør? Jeg ser at vi anser dette DNA som ikke-kodende, men betyr det at det er "søppel"? Jeg synes det er vanskelig å tro at det ikke kan fungere, ellers hvorfor ville DNA være der? Er det mulig at det brukes til ting vi ennå ikke forstår?

[Dette spørsmålet] (https://biology.stackexchange.com/questions/48148/what%C2%B4s-the-origin-of-junk-dna) inneholder mer informasjon om hva ikke-kodende DNA er, men jeg tror Remi har svart på om Ickes krav er riktig.
@David det er rimelig, men jeg stemte for å la dette være åpent og nedstemt. Jeg tror henvisningen til Ickes bok som tingen som utløste spørsmålet, og det faktiske spørsmålet (hva er søppel-DNA og vet vi hva det gjør) er på temaet (generelle spørsmål om biologiske begreper). Spørsmålet kan forbedres ved å fjerne referansen til boka av en profesjonell konspirasjonsteoretiker, siden den distraherer fra selve spørsmålet om biologi.
Jeg vil sjekke om det er andre spørsmål om søppel-DNA. Ellers rediger spørsmålet drastisk slik at det fortjener svar.
"Søppel-DNA" brukes ikke lenger. Dette begrepet oppsto lenge siden funksjonen til ikke-genisk / intergenisk DNA ikke var kjent. Jeg er ikke sikker på hvilken "mainstream science" han snakker om!
Jeg kunne ikke finne et passende tidligere spørsmål om søppel-DNA, så jeg har skrevet om spørsmålet. Jeg vil foreslå at svarene adresserer det som har blitt oppdaget de siste sju årene siden boka ble skrevet.
Jeg vil oppfordre folk til ikke å svare på dette med mindre de faktisk jobber i felten. Jeg vet ikke noe felt innen vitenskap som Dunning-Kruger-effekten gjelder mer for. Hvis du er trygg på at du forstår dette feltet, vil du nesten ikke gjøre det. Det er en stor og svært fokusert litteratur om dette, og nesten ingen utenfor feltet vet ikke engang at feltet eksisterer, enn si har lest noen av papirene i det. Hvis du ikke har lest minst 100 artikler spesifikt om emnet, vil svaret ditt være feil og misvisende.
@David Jeg tror redigeringen av tittelen innebærer at det en gang ble trodd at "søppel-DNA" er funksjonsløst; det er mulig det er tilfelle, men ikke så vidt jeg vet. Med mindre du har en referanse om at det faktisk ble antatt å være søppel-DNA på et tidspunkt, tror jeg den forrige redigerte tittelen "Har" søppel-DNA "ingen funksjon?" er mye bedre.
@BryanKrause - Jeg synes det er bedre å ikke bruke en form for ord som innebærer aksept av begrepet. Hva med "Har det meste av menneskelig DNA ingen funksjon?" og referer til følgende: http://www.junkdna.com/ohno.html?
@David Hva synes du om min kompromissredigering av tittelen? Jeg tror det er omtrent mellom hva hver enkelt av oss foreslår.
@BryanKrause Fin. Jeg legger til en lenke til Ohno-papiret osv. I spørsmålet for å gi det en liten sammenheng.
To svar:
Remi.b
2017-08-27 20:08:29 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Hva er søppel-DNA?

Uttrykket søppel-DNA brukes ikke så ofte i den vitenskapelige litteraturen, og når det er brukt, brukes det ofte veldig generelt, ofte tidlig i introduksjon. Det refererer generelt til ikke-kodende DNA.

Hos mennesker er omtrent 25% av det ikke-kodende DNA introner og regulatoriske sekvenser. Disse sekvensene er svært essensielle for organismen. Det er mange tilfeller av tilpasning fra disse reguleringssekvensene (se dette svaret).

Begrepet søppel-DNA er veldig belastet og kan få folk til å føle at dette DNA ikke er viktig for organismenes overlevelse, men dette er ikke helt det som først ble ment med begrepet søppel-DNA. Det er sant at gjentatt DNA som de som er i transponerbare elementer antas å ha liten innvirkning på organismen fenotype. Transponerbare elementer kan imidlertid ha en viktig rolle for utviklingen av en slekt.

IMO, påstanden er falsk og fornærmende

Ved å si ting som De gjør dette fordi de ikke hadde noen anelse om hva det gjør, og fra sin versjon av virkeligheten ser det ut til at de ikke tjener noen funksjon. , det føles for meg at David Icke bruker den lastede siden av begrepet søppel-DNA for å fornærme alle genetikere generelt.

D. Icke 1) gjør en stråmann ved å antyde at genetikere mener at regulatoriske sekvenser ikke er til nytte og 2) han antyder at genetikere er partisk og vil oppfinne hvilken teori som helst for å matche med en forutfattet mening om virkeligheten. p>

Om David Icke

Jeg mener ikke å lage en forsettlig feilslutning, men jeg vil merke at David Icke er en kjent konspirasjonsteoretiker som har vært ulogisk og åpenbart meningsbasert mange ganger. For eksempel hevder David Icke at månen faktisk er et romskip og ikke en naturlig satellitt (se her). Han har kommet med mange andre fantastiske påstander av den typen. Rull ned wikipedia-artikkelen for å glede deg over noe som ikke er sanselig!

Jeg vet mye om Ickes materiale. Noen er spot on og noen er sketchy, men jeg tror ikke ad hominem noen gang diskrediterer et argument, så det er sannsynligvis best å fjerne det siste avsnittet.
Du sier at det er 5-10% som er regulatorisk i det andre svaret, som jeg synes er mer nøyaktig
Remi.bs siste avsnitt er verken en ad hominem mot Icke eller bør slettes. Ickes vitenskapelige analfabetisme er relevant for å konkludere med at han ikke er i stand til å kritisere vitenskapelig konsensus (men i dette tilfellet er konsensusen om "søppel-DNA" oppfunnet). Mange av hans påstander er ekstraordinære, og bevisene som blir gitt, lar mye å være ønsket, så det han sier må tas med et saltkorn. For eksempel tror han på “monoatomisk gull”, et veldig problematisk konsept alene (https://rationalwiki.org/wiki/ORMUS).
Frieke
2019-02-26 19:24:19 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Begrepet "søppel-DNA" brukes ofte ikke mer av forskere. Det ble populært når folk innså at bare 1-2% av det menneskelige genomet koder for proteiner, og lurte på hvorfor det er så mye mer DNA hvis det ikke er nødvendig. Men vi vet i dag at det faktisk tjener mange funksjoner og derfor blir nå referert til som "ikke-kodende DNA".

Noen ikke-kodende DNA-funksjoner:

  • regulatoriske elementer: promotorer, forsterkere eller lyddempere er DNA-regioner, der transkripsjon eller andre bindingsfaktorer binder seg til DNA for å regulere tilgjengeligheten av gener til transkripsjonsmaskineriet og derfor kontrollere hvilke gener som uttrykkes
  • introner: DNA-regioner som settes inn i selve kodingsområdet og fjernes under skjøting. De har en rolle i RNA-prosessering og alternativ spleising.
  • funksjonell RNA: Å ikke bli oversatt til et protein betyr ikke at RNA produsert av et sted ikke tjener et funksjon i cellen (f.eks. ribosomale RNAer, mikroRNAer)
  • strukturelle elementer: telomerer og sentromerer er viktige for kromosomstabilitet, søsterkromatidbinding, heterokromatindannelse og forankring til kjernekonvolutten

Vi fortsetter å lære mer og mer om forskjellige funksjoner i DNA-regioner. Selv åpne leserammer (ORFer), som koder for funksjonelle RNA eller til og med små proteiner, blir stadig identifisert. Det er derfor ikke sant at det ikke tjener noen funksjon, fordi vi har identifisert mange funksjoner. Og mens vi fremdeles ikke vet alt om det, øker kunnskapen vår.

Videre lesing:

Shanmugam et al. 2017 - Ikke-kodende DNA - en kort gjennomgang

NIH Genetic Home Reference - Hva er ikke-kodende DNA?

Wikipedia - DNA som ikke er kodende

Hvor mye av 90-97% tror du poengene du nevner dekker? Det eneste punktet som er veldig nytt i dette århundret er "funksjonell RNA". Det kan være sant at "vi fortsetter å lære mer", men det svarer knapt på spørsmålet.
På den annen side [store segmenter av ikke-kodende DNA er fjernet fra mus uten noen åpenbar innvirkning på deres fenotype] (https://www.nature.com/news/2004/041018/full/041018-7.html) . Det er et komplekst tema som langt fra er avgjort.
-1
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5570035/


Denne spørsmålet ble automatisk oversatt fra engelsk.Det opprinnelige innholdet er tilgjengelig på stackexchange, som vi takker for cc by-sa 3.0-lisensen den distribueres under.
Loading...